Santa Margarita es una ciudad y un lugar designado por el censo ubicado en el condado de San Luis Obispo, California. Fue fundado en 1889 cerca de Cuesta Peak y San Luis Obispo a lo largo de la ruta estatal 58. El nombre de la ciudad proviene de la concesión de tierras mexicana de Alta California de Rancho Santa Margarita. Es el hogar del sitio de Asistencia de Santa Margarita de Cortona. La población era de 1.259 en el censo de 2010.